Båten fraktet minst 80 passasjerer på elven Malale i delstaten Niger da ulykken skjedde tirsdag. Det opplyste Røde Kors-representant Abubakar Idris til nyhetsbyrået AFP onsdag.
10 personer er funnet alvorlig skadd, og det letes fortsatt etter mange.
Ifølge Røde Kors knyttes ulykken til at det for mange om bord på båten og at den kolliderte med en trestamme i elva.
Det er noe usikkerhet om hvor mange som var på båten, noen sier 80, andre 100.
Det er ikke uvanlig med ulykker Nigerias travle elver. Ofte er årsaken overfylte båter, dårlig vedlikehold eller dårlig sikkerhet, skriver nyhetsbyrået.